RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SERINC5Q86VE9 423 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 MICU3Q86XE3 530 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 FANCBQ8NB91 859 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 GPR20Q99678 358 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 DEFB103AP81534 67 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TAP1Q03518 808 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 MBTPS1Q14703 1052 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 NLRX1Q86UT6 975 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 USP26Q9BXU7 913 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 UBE2SQ16763 222 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM50Q86XT4 487 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 NEK1Q96PY6 1258 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 THEGQ9P2T0 379 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 EPOPA6NHQ4 379 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TREHO43280 583 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 RSPH10BP0C881 870 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 IKBKEQ14164 716 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SETD4Q9NVD3 440 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 LCHNA4D1U4 455 aa22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 LGR5O75473 907 aa22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.21■■□□□ 1.15
CHTF18-218ENST00000569270 VCANP13611 3396 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 HOXC8P31273 242 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 APOA5Q6Q788 366 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 SPRED2Q7Z698 418 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ASB2Q96Q27 587 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 EMSYQ7Z589 1322 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 EFCAB14O75071 495 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ATP9AO75110 1047 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 CDC45O75419 566 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 CTSHP09668 335 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GNAT1P11488 350 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ITGB5P18084 799 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 RASEFQ8IZ41 740 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GPRASP2Q96D09 838 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 CDHR1Q96JP9 859 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 SCN5AQ14524 2016 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GJB5O95377 273 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ARHGAP4P98171 946 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 MTMR1Q13613 665 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 KRT40Q6A162 431 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 RAD9AQ99638 391 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 ZBTB43O43298 467 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 KCNA2P16389 499 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 RTN1Q16799 776 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 NAPAP54920 295 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 GRB10Q13322 594 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 JADE2Q9NQC1 790 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 MYH6P13533 1939 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-218ENST00000569270 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.15■■□□□ 1.14
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