RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 METTL7BQ6UX53 244 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 NEK8Q86SG6 692 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 PPTC7Q8NI37 304 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA33Q96N06 139 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 A0A1W2PQY0 241 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 KIF28PB7ZC32 967 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 ZEB2O60315 1214 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 MMP3P08254 477 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 LETM2Q2VYF4 491 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 MBOAT7Q96N66 472 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 Q4G0T1 1027 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 UIMC1Q96RL1 719 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-208ENST00000566059 H3BQV1 296 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 NFASCO94856 1347 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 MSH4O15457 936 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 MYL3P08590 195 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 DGKDQ16760 1214 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GPR20Q99678 358 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 WNT7AO00755 349 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SLC37A4O43826 429 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 PPFIA4O75335 1185 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SP4Q02446 784 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SDF4Q9BRK5 362 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ELP1O95163 1332 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 KPNA6O60684 536 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 CABYRO75952 493 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 MCTP1Q6DN14 999 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 PDCP20941 246 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SYT1P21579 422 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GJA10Q969M2 543 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GRIN2DO15399 1336 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 PSMC6P62333 389 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 KAT2BQ92831 832 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SLC5A5Q92911 643 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 CCNE2O96020 404 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF286BP0CG31 522 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ATP2B1P20020 1258 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SNX17Q15036 470 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 ACTR2P61160 394 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 POTEDQ86YR6 584 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 RIT2Q99578 217 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-208ENST00000566059 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 F2P00734 622 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 LGALS2P05162 132 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 CDK7P50613 346 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 ITGA7Q13683 1181 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 HAS1Q92839 578 aa20.27■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 ARVCFO00192 962 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 PSMD10O75832 226 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 TRAPPC10P48553 1259 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-208ENST00000566059 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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