RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123		H7BY64	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	N4BP3	O15049	544 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PYGM	P11217	842 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GNAT1	P11488	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CNGA1	P29973	690 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ARL4A	P40617	200 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CABP7	Q86V35	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	UBR7	Q8N806	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		B4E1Z4	1266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		M0R2C6	588 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NTRK1	P04629	796 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	COL6A2	P12110	1019 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KRT15	P19012	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FLT3	P36888	993 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ST5	P78524	1137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CKM	P06732	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CELA3B	P08861	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PNLIP	P16233	465 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KCNA6	P17658	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	SOX5	P35711	763 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	STAT3	P40763	770 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MROH9	Q5TGP6	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		Q8N1Y9	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123		X6R8D5	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	KCNK3	O14649	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GSTA4	O15217	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DGKI	O75912	1065 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DBH	P09172	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	GLI4	P10075	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CRY1	Q16526	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RNF180	Q86T96	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BBS2-208	ENST00000564123	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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