RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.53□□□□□ -1.04
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 STXBP3O00186 592 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPFIA4O75335 1185 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GGPS1O95749 300 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 F2P00734 622 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 APOBRQ0VD83 1088 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 E2F4Q16254 413 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NTRK3Q16288 839 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM240Q5SV17 173 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RUFY3Q7L099 469 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TET1Q8NFU7 2136 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 BRF1Q92994 677 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 VWCEQ96DN2 955 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL17RAQ96F46 866 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HIPK3Q9H422 1215 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 BARHL2Q9NY43 387 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.52□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ESYT2A0FGR8 921 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FIBPO43427 364 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CSF2RAP15509 400 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HOXC8P31273 242 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP2C18P33260 490 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RBL2Q08999 1139 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NEDD9Q14511 834 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PKN1Q16512 942 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNPTABQ3T906 1256 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 METTL7BQ6UX53 244 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM199Q8N511 208 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GPRASP2Q96D09 838 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPATA33Q96N06 139 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GLT8D2Q9H1C3 349 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.51□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 MAFGO15525 162 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP2C9P11712 490 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCG2P13521 617 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KCNA2P16389 499 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFNAR1P17181 557 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITGB5P18084 799 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSEN2P49810 448 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAPAP54920 295 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 FGD1P98174 961 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCN5AQ14524 2016 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBE2SQ16763 222 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 NLRX1Q86UT6 975 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 HERVK_113Q902F9 699 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 CDHR1Q96JP9 859 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 IL23AQ9NPF7 189 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.5□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 KAT6AQ92794 2004 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMCO2A6NFE2 343 aa8.49□□□□□ -1.05
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms