RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 C8BP07358 591 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RBL2Q08999 1139 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 LSAMPQ13449 338 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 NTRK3Q16288 839 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 LIPIQ6XZB0 460 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SPATC1Q76KD6 591 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ARMC5Q96C12 935 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM169Q96HH4 297 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DRC1Q96MC2 740 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 BTG4Q9NY30 223 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 KIAA0556O60303 1618 aa6.32□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SERINC3Q13530 473 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RASGRF1Q13972 1273 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 MTERF2Q49AM1 385 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PALD1Q9ULE6 856 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 HFM1A2PYH4 1435 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 NAIPQ13075 1403 aa6.31□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 MYO1BO43795 1136 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ADCY3O60266 1144 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SLURP1P55000 103 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SP8Q8IXZ3 490 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 CEP170Q5SW79 1584 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 TONSLQ96HA7 1378 aa6.3□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SYNJ2O15056 1496 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 A0A1B0GTL3 188 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 CR1LQ2VPA4 569 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SYT8Q8NBV8 401 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FBXO41Q8TF61 875 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SYT3Q9BQG1 590 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 NUP160Q12769 1436 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 MIA2Q96PC5 1412 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PRODHO43272 600 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SASH1O94885 1247 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 CTSWP56202 376 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RASA3Q14644 834 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PRR31Q5SQ13 230 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 STYK1Q6J9G0 422 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 USP53Q70EK8 1073 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DCAF4Q8WV16 495 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 DDX11Q96FC9 970 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 CLDND1Q9NY35 253 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 SNTG2Q9NY99 539 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.28□□□□□ -1.4
ATXN3-246ENST00000557030 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 UACAQ9BZF9 1416 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 CYP2C8P10632 490 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 CHRNA2Q15822 529 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.27□□□□□ -1.41
ATXN3-246ENST00000557030 NSMFQ6X4W1 530 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms