RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		7.95	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZBTB5	O15062	677 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	KDM4A	O75164	1064 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GGPS1	O95749	300 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CCND2	P30279	289 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HOXC8	P31273	242 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NEDD9	Q14511	834 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PGM5	Q15124	567 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	WNT8B	Q93098	351 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	KRT23	Q9C075	422 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CPVL	Q9H3G5	476 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NEDD4	P46934	1319 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		7.94	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LCT	P09848	1927 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SCN5A	Q14524	2016 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HIP1	O00291	1037 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RGS20	O76081	388 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	UPP2	O95045	317 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	POLR2M	P0CAP2	368 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CHML	P26374	656 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	BMPR1A	P36894	532 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MRE11	P49959	708 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SP2	Q02086	613 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZP2	Q05996	745 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HIC1	Q14526	733 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PKN1	Q16512	942 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FIBCD1	Q8N539	461 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	MTMR8	Q96EF0	704 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CLDND1	Q9NY35	253 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	EYS	Q5T1H1	3165 aa		7.93	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688		B4E1Z4	1266 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	KLRF2	D3W0D1	207 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	OPLAH	O14841	1288 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TREH	O43280	583 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	LGALS2	P05162	132 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	ICAM3	P32942	547 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NHLH1	Q02575	133 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	METTL7B	Q6UX53	244 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	RPAIN	Q86UA6	219 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FBXL18	Q96ME1	805 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PRRX2	Q99811	253 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NRCAM	Q92823	1304 aa		7.92	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	TET1	Q8NFU7	2136 aa		7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	FIBP	O43427	364 aa		7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	CDC45	O75419	566 aa		7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	PTH1R	Q03431	593 aa		7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
CS-233	ENST00000552688	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.91	□□□□□ -1.14

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