RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	CPVL	Q9H3G5	476 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	GRIN2D	O15399	1336 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	ABCB11	O95342	1321 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	ZEB2	O60315	1214 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	CDC45	O75419	566 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	PTGS1	P23219	599 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	FPGS	Q05932	587 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	MFSD5	Q6N075	450 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	MTMR8	Q96EF0	704 aa		7.4	□□□□□ -1.22
FGD4-215	ENST00000551984	AP5Z1	O43299	807 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MAP3K7	O43318	606 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CALML3	P27482	149 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS12	P56730	875 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	GHRHR	Q02643	423 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PTH1R	Q03431	593 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	GUCD1	Q96NT3	240 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		7.4	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SGSM2	O43147	1006 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	BRD1	O95696	1058 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CYP21A2	P08686	494 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	USH1G	Q495M9	461 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984		B4DLN1	442 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TPM3	P06753	285 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PDE4D	Q08499	809 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM240	Q5SV17	173 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SCFD2	Q8WU76	684 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TBC1D5	Q92609	795 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	GBF1	Q92538	1859 aa		7.39	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CPT1A	P50416	773 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	LAPTM4A	Q15012	233 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SPC24	Q8NBT2	197 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	MAP4K1	Q92918	833 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23	7e-9	■■■■■ 42.7
FGD4-215	ENST00000551984	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	COL20A1	Q9P218	1284 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984		A6NJR5	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984		E7EWF7	191 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	OPLAH	O14841	1288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	B4GALT4	O60513	344 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	ARIH2	O95376	493 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	HSD17B4	P51659	736 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PSMC6	P62333	389 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TRDN	Q13061	729 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	GRM4	Q14833	912 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	PPP2R5B	Q15173	497 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM199	Q8N511	208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
FGD4-215	ENST00000551984	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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