RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ANO3Q9BYT9 981 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 HIPK3Q9H422 1215 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 JADE2Q9NQC1 790 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.91□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 GNA11P29992 359 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ZNF76P36508 570 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 PSEN2P49810 448 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NLRP5P59047 1200 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 FPGSQ05932 587 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 MFSD10Q14728 455 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 SHHQ15465 462 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 METTL7BQ6UX53 244 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 C7orf31Q8N865 590 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 NECAB1Q8N987 351 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 GPRASP2Q96D09 838 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 CDHR1Q96JP9 859 aa14.9□□□□□ -0.02
USP15-217ENST00000551206 ESYT2A0FGR8 921 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PFKFB2O60825 505 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CSF2RAP15509 400 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CCL23P55773 120 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ARHGAP4P98171 946 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 AP3B2Q13367 1082 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MFSD5Q6N075 450 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 IL17RAQ96F46 866 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 AIFM3Q96NN9 605 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PHF12Q96QT6 1004 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 UIMC1Q96RL1 719 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GPR20Q99678 358 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 NOD1Q9Y239 953 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.89□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CDKL5O76039 1030 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 DEXIO95424 95 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ARP10275 920 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ACRP10323 421 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KCNA2P16389 499 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SREBF1P36956 1147 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PTGISQ16647 500 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CEP55Q53EZ4 464 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 TMEM199Q8N511 208 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 BICD2Q8TD16 824 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.88□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 H3BRB1 525 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MAFGO15525 162 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 F2P00734 622 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 LGALS2P05162 132 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ME3Q16798 604 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 LRCH3Q96II8 777 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 FAM86B1E9PN63 330 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 HAS3O00219 553 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MEIS1O00470 390 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 LARGE1O95461 756 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 CTDNEP1O95476 244 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 MCTP2Q6DN12 878 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 TRIM50Q86XT4 487 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 RETREG2Q8NC44 543 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SCLYQ96I15 445 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SDF4Q9BRK5 362 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.86□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SESTD1Q86VW0 696 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP15-217ENST00000551206 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms