RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FERMT3Q86UX7 667 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ZNF576Q9H609 170 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 VTNP04004 478 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ITGB5P18084 799 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MTMR1Q13613 665 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 APOL6Q9BWW8 343 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CDH22Q9UJ99 828 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SIPA1L1O43166 1804 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TLL1O43897 1013 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 COL6A1P12109 1028 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 KSR1Q8IVT5 923 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 OXER1Q8TDS5 423 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CTAGE5O15320 804 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PTPRFP10586 1907 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MEIS1O00470 390 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PER2O15055 1255 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GH1P01241 217 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PLCB4Q15147 1175 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NLRX1Q86UT6 975 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PANK2Q9BZ23 570 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GINM1Q9NU53 330 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DOCK1Q14185 1865 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TDP2O95551 362 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CLCN3P51790 818 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 DGKDQ16760 1214 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TMEM199Q8N511 208 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 BANK1Q8NDB2 785 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TIFAQ96CG3 184 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FAM186AA6NE01 2351 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 LAMA1P25391 3075 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MEIS2O14770 477 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MMP3P08254 477 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 WEE2P0C1S8 567 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 KCNJ6P48051 423 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 KCNQ1P51787 676 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MFSD10Q14728 455 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 GRM4Q14833 912 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-212ENST00000548567 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CPT1AP50416 773 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TCTN1Q2MV58 587 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 MTERF2Q49AM1 385 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 TMEM240Q5SV17 173 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FAM86B1E9PN63 330 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ZEB2O60315 1214 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 AK2P54819 239 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 NPEPPSP55786 919 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 ARHGAP1Q07960 439 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-212ENST00000548567 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.58□□□□□ -1.04
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