RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 PIK3CDO00329 1044 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 SERPINC1P01008 464 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 TUBB4AP04350 444 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 ZNF18P17022 549 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 CYP3A7P24462 503 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-204ENST00000546621 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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CS-204ENST00000546621 TATDN2Q93075 761 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 CALML4Q96GE6 196 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-204ENST00000546621 MED15Q96RN5 788 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 PLIN2Q99541 437 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.65□□□□□ -1.02
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CS-204ENST00000546621 ST7Q9NRC1 585 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 FEM1BQ9UK73 627 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-204ENST00000546621 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 H7C1D1 291 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 OPLAHO14841 1288 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 MARCH6O60337 910 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SREBF1P36956 1147 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 RWDD2BP57060 319 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 UBASH3AP57075 661 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ARHGAP4P98171 946 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 GRB10Q13322 594 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KCNB1Q14721 858 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SPATA1Q5VX52 437 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 DCAF15Q66K64 600 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 HAS1Q92839 578 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KIFC2Q96AC6 838 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SH3GL3Q99963 347 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 STK17AQ9UEE5 414 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KLRC4O43908 158 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LMNB1P20700 586 aa8.64□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 AMPD3Q01432 767 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LRMPQ12912 555 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CRYMQ14894 314 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 Q4G0T1 1027 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KRT79Q5XKE5 535 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CCDC174Q6PII3 467 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 LPAR1Q92633 364 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 PNMA5Q96PV4 448 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TRIM9Q9C026 710 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 DOCK1Q14185 1865 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 SLC26A4O43511 780 aa8.63□□□□□ -1.03
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CS-204ENST00000546621 MAGEA8P43361 318 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 STX17P56962 302 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 PAK1Q13153 545 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 NEDD9Q14511 834 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 CEP135Q66GS9 1140 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-204ENST00000546621 TMC6Q7Z403 805 aa8.63□□□□□ -1.03
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