RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ADAM17P78536 824 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 SEMA3FQ13275 785 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 IKBKEQ14164 716 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 WNT8BQ93098 351 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 RAD9AQ99638 391 aa21.52■■□□□ 1.04
LTBR-211ENST00000543190 TNFRSF10AO00220 468 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 LGR5O75473 907 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF15O94989 841 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 AAK1Q2M2I8 961 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CASC1Q6TDU7 716 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 RPAINQ86UA6 219 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GPR20Q99678 358 aa21.51■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 MAFGO15525 162 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 PRC1O43663 620 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 LPXNO60711 386 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CHMP4BP1P59074 171 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CUL5Q93034 780 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GPRASP2Q96D09 838 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CDHR1Q96JP9 859 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 COG5Q9UP83 839 aa21.5■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 EPOPA6NHQ4 379 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GNAT1P11488 350 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 DEFB103AP81534 67 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 TCTN1Q2MV58 587 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.49■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SLC27A2O14975 620 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 RSPH10BP0C881 870 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 BMP1P13497 986 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ERVK-21P61565 698 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 FAM26DQ5JW98 314 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 PPM1EQ8WY54 764 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 NLRX1Q86UT6 975 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 NRCAMQ92823 1304 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.47■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 TTC3P53804 2025 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 LCHNA4D1U4 455 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CCDC69A6NI79 296 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 GRB10Q13322 594 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 FANCBQ8NB91 859 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 MYL10Q9BUA6 226 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 INSL6Q9Y581 213 aa21.46■■□□□ 1.03
LTBR-211ENST00000543190 LINC01553A4QN01 128 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TREHO43280 583 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 KCNA2P16389 499 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 THPOP40225 353 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RCAN1P53805 252 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 APBB2Q92870 758 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.45■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RFXAPO00287 272 aa21.44■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.44■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 AMHP03971 560 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 ITGB5P18084 799 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 RNF20Q5VTR2 975 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 TOP1MTQ969P6 601 aa21.43■■□□□ 1.02
LTBR-211ENST00000543190 SAMD11Q96NU1 681 aa21.43■■□□□ 1.02
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