RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 POTEFA5A3E0 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TTC34A8MYJ7 566 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 F8W031 263 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CES2O00748 559 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PPP6R2O75170 966 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 POTEIP0CG38 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TPBGLP0DKB5 382 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PLCG2P16885 1265 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TMOD1P28289 359 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CDK7P50613 346 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SEC24CP53992 1094 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 FOXK1P85037 733 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 MCL1Q07820 350 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PLS1Q14651 629 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 LIN52Q52LA3 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 BOLA3Q53S33 107 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 IL23RQ5VWK5 629 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 KANK3Q6NY19 840 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 C11orf74Q86VG3 221 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC125Q86Z20 511 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PLPP6Q8IY26 295 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 NUP93Q8N1F7 819 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 KLHL29Q96CT2 875 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF333Q96JL9 665 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 USP28Q96RU2 1077 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 DESI2Q9BSY9 194 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 BTBD7Q9P203 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ABCC1P33527 1531 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.69□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 AKR1B10O60218 316 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GABBR2O75899 941 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 BBOX1O75936 387 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SUN1O94901 812 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 GJB6O95452 261 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ASMTLO95671 621 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RARAP10276 462 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 KCNA3P22001 575 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RFC5P40937 340 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RASSF2P50749 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ATP1A2P50993 1020 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 NDUFA8P51970 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CACNA2D1P54289 1103 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ACVR2BQ13705 512 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF6Q15052 776 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 IER5LQ5T953 404 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 FNDC8Q8TC99 324 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RAPGEF5Q92565 580 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 RILPL2Q969X0 211 aa6.68□□□□□ -1.34
SNHG1-211ENST00000539921 SKA1Q96BD8 255 aa6.68□□□□□ -1.34
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