RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 NR2F2P24468 414 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 AP3B2Q13367 1082 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PARVGQ9HBI0 331 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CIB2O75838 187 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 STAT3P40763 770 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SPDYE6P0CI01 402 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CETPP11597 493 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 LMNB1P20700 586 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 FCGRTP55899 365 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 HHATQ5VTY9 493 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GDAP1Q8TB36 358 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PRELPP51888 382 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 EPHB1P54762 984 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CCL15Q16663 113 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PTPROQ16827 1216 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SCN4BQ8IWT1 228 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TACC3Q9Y6A5 838 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GOLGA8JA6NMD2 632 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 COBLO75128 1261 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G4BP0C869 781 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2B6P20813 491 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ADCY8P40145 1251 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD2Q13200 908 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PHBP35232 272 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PEX3P56589 373 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 THNSL1Q8IYQ7 743 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CCNYQ8ND76 341 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 EPSTI1Q96J88 318 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 FAM81BQ96LP2 452 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GBP1P32455 592 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 MAP7Q14244 749 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 BUB1O43683 1085 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 KRT15P19012 456 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP4P98171 946 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 AFG1LQ8WV93 481 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TTC1Q99614 292 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ARL4AP40617 200 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PPFIA1Q13136 1202 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 BEST2Q8NFU1 509 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM11Q96F44 468 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 USP28Q96RU2 1077 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 LAMC1P11047 1609 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 MMP1P03956 469 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 MAP4K1Q92918 833 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 RRAGCQ9HB90 399 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SH3GLB2Q9NR46 395 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ALCAMQ13740 583 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 GPC3P51654 580 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF827Q17R98 1081 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 SWSAP1Q6NVH7 229 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms