RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 FOSBP53539 338 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 NKX3-2P78367 333 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 MTMR1Q13613 665 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 NEDD9Q14511 834 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ME3Q16798 604 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF3C6Q969F1 213 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 CDHR1Q96JP9 859 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 AIFM3Q96NN9 605 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ALG1Q9BT22 464 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 NOD1Q9Y239 953 aa13.09□□□□□ -0.31
UBASH3B-208ENST00000533451 TGFB3P10600 412 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 RAG1P15918 1043 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ARHGAP4P98171 946 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SP2Q02086 613 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf53Q5VUE5 145 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PPTC7Q8NI37 304 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 WASF1Q92558 559 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 GPRASP2Q96D09 838 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.08□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 LTBP2Q14767 1821 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ST18O60284 1047 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ITGB5P18084 799 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SREBF1P36956 1147 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 RABEP1Q15276 862 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF20Q3BBV1 942 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 MCTP2Q6DN12 878 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 C7orf31Q8N865 590 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 IL17RAQ96F46 866 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 UIMC1Q96RL1 719 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SDF4Q9BRK5 362 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 STK36Q9NRP7 1315 aa13.07□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAMTS3O15072 1205 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ICAM3P32942 547 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 FAAP100Q0VG06 881 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SEMA3FQ13275 785 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM29Q14134 588 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 MFSD10Q14728 455 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CEP55Q53EZ4 464 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 METTL7BQ6UX53 244 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 BADQ92934 168 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TOX2Q96NM4 488 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 JADE2Q9NQC1 790 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.06□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 B4GALT4O60513 344 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 JAK2O60674 1132 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PPFIA4O75335 1185 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CTDNEP1O95476 244 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PSEN2P49810 448 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CDK7P50613 346 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 BLIDQ8IZY5 108 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF2CQ99661 725 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 GRIN2DO15399 1336 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KAT6AQ92794 2004 aa13.05□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.04□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP9AO75110 1047 aa13.04□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 LGALS2P05162 132 aa13.04□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa13.04□□□□□ -0.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ARP10275 920 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms