RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	GATA6	Q92908	595 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	SLC5A5	Q92911	643 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	BTG4	Q9NY30	223 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MED17-208	ENST00000531920	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920		K7ESF4	209 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	KCNK3	O14649	394 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	PRRG2	O14669	202 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	WNT9A	O14904	365 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TGM5	O43548	720 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	MYO1B	O43795	1136 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	KRT15	P19012	456 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	BCL6	P41182	706 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	SCAND1	P57086	179 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	SESN3	P58005	492 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FAP	Q12884	760 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LSAMP	Q13449	338 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CRY1	Q16526	586 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	BROX	Q5VW32	411 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ZPBP2	Q6X784	338 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	OSTM1	Q86WC4	334 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	JAM3	Q9BX67	310 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CLDND1	Q9NY35	253 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920		H3BS24	57 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FZD9	O00144	591 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	PDE6A	P16499	860 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	SLC9A1	P19634	815 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	JAM2	P57087	298 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ODF1	Q14990	250 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	BRD3	Q15059	726 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CPA6	Q8N4T0	437 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LRGUK	Q96M69	825 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	OBP2A	Q9NY56	170 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920		U3KQE9	123 aa		5.82	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	C7orf72	A4D263	438 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920		H7C1D1	291 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	TBC1D8	O95759	1140 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	BOC	Q9BWV1	1114 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	MKS1	Q9NXB0	559 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	PCDHGA12	O60330	932 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CFB	P00751	764 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	COL6A2	P12110	1019 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LTK	P29376	864 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	OXCT1	P55809	520 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LRRC32	Q14392	662 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	ZNF174	Q15697	407 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CLUL1	Q15846	466 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	RGL3	Q3MIN7	710 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	CEP68	Q76N32	757 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MED17-208	ENST00000531920	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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