RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	GGN	Q86UU5	652 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PDPK1	O15530	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	SOD2	P04179	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	GPR85	P60893	370 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	TUSC3	Q13454	348 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	KRIT1	O00522	736 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ITGB3	P05106	788 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760		K7ESM1	405 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ACOT7	O00154	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	B4GALT3	O60512	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CKM	P06732	381 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	GNAT1	P11488	350 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	COL6A1	P12109	1028 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	GLRB	P48167	497 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CDK1-208	ENST00000519760	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	MAFK	O60675	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PLAT	P00750	562 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ADRB1	P08588	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FAH	P16930	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	LGI4	Q8N135	537 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CDC6	Q99741	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PTPN18	Q99952	460 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	DSE	Q9UL01	958 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PFKP	Q01813	784 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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