RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TADA3O75528 432 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 CYP2C8P10632 490 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 MAP4K2Q12851 820 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 PRR31Q5SQ13 230 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 UBXN11Q5T124 520 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM169Q96HH4 297 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 DISP1Q96F81 1524 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 FANCAO15360 1455 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 LSAMPQ13449 338 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 RTP5Q14D33 572 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 DDR2Q16832 855 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 CR1LQ2VPA4 569 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 EMC4Q5J8M3 183 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 KYQ8NBH2 561 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 NTMQ9P121 344 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 PTPRTO14522 1441 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-217ENST00000509355 DLX3O60479 287 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 THBS2P35442 1172 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ITGA1P56199 1179 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 FERMT3Q86UX7 667 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 SGSM3Q96HU1 749 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 LNPKQ9C0E8 428 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 AKNAQ7Z591 1439 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 MYO1BO43795 1136 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 HSPA1LP34931 641 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 KCNJ6P48051 423 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 NFKB2Q00653 900 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ST7Q9NRC1 585 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 NEO1Q92859 1461 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 EFEMP1Q12805 493 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 GPR27Q9NS67 375 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 MSCO60682 206 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 STAT5AP42229 794 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM9Q13443 819 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 RAB33AQ14088 237 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 IER2Q9BTL4 223 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 JAG2Q9Y219 1238 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 AGRPO00253 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ADRB1P08588 477 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 CHRNA2Q15822 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 TTLL6Q8N841 843 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 OSBP2Q969R2 916 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 CLDND1Q9NY35 253 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 WASF3Q9UPY6 502 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0556O60303 1618 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 TOM1O60784 492 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 LRG1P02750 347 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 FGFR1P11362 822 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 GJA9P57773 515 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 NTRK3Q16288 839 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 SPATS1Q496A3 300 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 STEAP3Q658P3 488 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 GGNQ86UU5 652 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 STK32CQ86UX6 486 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-217ENST00000509355 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms