RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 PRR16Q569H4 304 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 COPS5Q92905 334 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 RIT2Q99578 217 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 ITGA7Q13683 1181 aa16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 FAM86B1E9PN63 330 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC26A2P50443 739 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SP2Q02086 613 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 BECN1Q14457 450 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 INF2Q27J81 1249 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LETM2Q2VYF4 491 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 GNAT1P11488 350 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SFNP31947 248 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 MBOAT7Q96N66 472 aa16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS7O60861 476 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP9AO75110 1047 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 F2P00734 622 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ARP10275 920 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK7P50613 346 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 RTP1P59025 263 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C7orf31Q8N865 590 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF25Q93038 417 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BRB1 525 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 47.8
SH3BP2-208ENST00000504294 JAK3P52333 1124 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 FOSBP53539 338 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 GUCY1B3Q02153 619 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 NR5A1Q13285 461 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC26Q2I0M4 334 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP2-208ENST00000504294 MCTP1Q6DN14 999 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 SESTD1Q86VW0 696 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 OXER1Q8TDS5 423 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP2-208ENST00000504294 WDR64B1ANS9 1081 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 MSH4O15457 936 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG7O95352 703 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 LGALS2P05162 132 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 PSAPP07602 524 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 PSEN2P49810 448 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTR2P61160 394 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD10Q14728 455 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.44■□□□□ 0.22
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