RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	HTRA3	P83110	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047		B4E1Z4	1266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CYP7B1	O75881	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	NPTXR	O95502	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	DNM2	P50570	870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TUSC3	Q13454	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TCEA2	Q15560	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	KY	Q8NBH2	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	APPBP2	Q92624	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	NTM	Q9P121	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SASH1	O94885	1247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	ASMTL	O95671	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	PDE6A	P16499	860 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	KRT15	P19012	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	GJA4	P35212	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	IGFALS	P35858	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	FLT3	P36888	993 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	EPHA5	P54756	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	GRIN1	Q05586	938 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATXN3-208	ENST00000504047	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	FFAR3	O14843	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	RASGRP1	O95267	797 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	LRG1	P02750	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	LTF	P02788	710 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	ASL	P04424	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	FAH	P16930	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	BMP7	P18075	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	KCNC1	P48547	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	ITGA1	P56199	1179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	SCLY	Q96I15	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	OPA1	O60313	960 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	CDC45	O75419	566 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	RFPL3	O75679	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	THBS2	P35442	1172 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATXN3-208	ENST00000504047	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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