RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.91□□□□□ -1.3
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ15Q99712 375 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALG1Q9BT22 464 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTMQ9P121 344 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYOTQ9UBF9 498 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARVCFO00192 962 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUCY1A3Q02108 690 aa6.9□□□□□ -1.3
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