RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495212.1

HDGF-209, Transcript of heparin binding growth factor, humanhuman

TSL 3

Gene HDGF, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGF-209ENST00000495212 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.97■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.97■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 FIBPO43427 364 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 PTK7Q13308 1070 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 GPR20Q99678 358 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.96■■□□□ 1.27
HDGF-209ENST00000495212 H3BRB1 525 aa22.95■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 ATP9AO75110 1047 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 STAM2O75886 525 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 CA3P07451 260 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 IGFBP4P22692 258 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 RBL2Q08999 1139 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 NEDD9Q14511 834 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 MBTPS1Q14703 1052 aa22.95■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 METTL7BQ6UX53 244 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.95■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 PGBD1Q96JS3 809 aa22.95■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 TREHO43280 583 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 DEFB103AP81534 67 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 FUT2Q10981 343 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SPRED2Q7Z698 418 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.94■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 ZBTB43O43298 467 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 ITGB5P18084 799 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 CDC27P30260 824 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 RTN1Q16799 776 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 NLRX1Q86UT6 975 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SLC9A7Q96T83 725 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SETD4Q9NVD3 440 aa22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 EPOPA6NHQ4 379 aa22.92■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.92■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.91■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SERINC5Q86VE9 423 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 BAIAP3O94812 1187 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 HOXC8P31273 242 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 KCNJ6P48051 423 aa22.9■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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HDGF-209ENST00000495212 USP26Q9BXU7 913 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 TMEM260Q9NX78 707 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.9■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 KAT6AQ92794 2004 aa22.89■■□□□ 1.26
HDGF-209ENST00000495212 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.89■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 CTSHP09668 335 aa22.89■■□□□ 1.25
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HDGF-209ENST00000495212 ADAMTS3O15072 1205 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 MARK3P27448 753 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 TAP1Q03518 808 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 KRT40Q6A162 431 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.252e-9■□□□□ 10.4
HDGF-209ENST00000495212 JADE2Q9NQC1 790 aa22.88■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.87■■□□□ 1.25
HDGF-209ENST00000495212 TLL1O43897 1013 aa22.87■■□□□ 1.25
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