RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493792.1

TRAPPC12-222, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IGFBP4	P22692	258 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GNA11	P29992	359 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF76	P36508	570 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.9	□□□□□ -0.5	1e-8	■■■■■ 35
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ANO3	Q9BYT9	981 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ARVCF	O00192	962 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	STAM2	O75886	525 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CABYR	O75952	493 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RGS20	O76081	388 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LARGE1	O95461	756 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PSMC6	P62333	389 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SP4	Q02446	784 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TFF2	Q03403	129 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ME3	Q16798	604 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		11.89	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	REV3L	O60673	3130 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ESYT2	A0FGR8	921 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FIBP	O43427	364 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CD4	P01730	458 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TGFB3	P10600	412 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	XBP1	P17861	261 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FOSB	P53539	338 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	VWCE	Q96DN2	955 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPATA33	Q96N06	139 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A6NJR5	290 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KPNA6	O60684	536 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MMP3	P08254	477 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYP2C18	P33260	490 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNQ1	P51787	676 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SP2	Q02086	613 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MTMR1	Q13613	665 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NEDD9	Q14511	834 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RABEP1	Q15276	862 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RAB30	Q15771	203 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DGKD	Q16760	1214 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	WASF1	Q92558	559 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GPRASP2	Q96D09	838 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.87	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ST18	O60284	1047 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ITGB5	P18084	799 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ICAM3	P32942	547 aa		11.86	□□□□□ -0.51
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SREBF1	P36956	1147 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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