RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 MMP19Q99542 508 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 MTRQ99707 1265 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 PANK2Q9BZ23 570 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 MCM3APO60318 1980 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 NFASCO94856 1347 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 ARID2Q68CP9 1835 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 RASSF10A6NK89 507 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 GAS7O60861 476 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 FCER1AP12319 257 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 RPA1P27694 616 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 TM4SF4P48230 202 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 NEK9Q8TD19 979 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 EFCC1Q9HA90 598 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf3-220ENST00000489318 B4DLN1 442 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EML1O00423 815 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 STRNO43815 780 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MED24O75448 989 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KCNA2P16389 499 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MAPK4P31152 587 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GRB14Q14449 540 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 STXBP2Q15833 593 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ECM1Q16610 540 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GNPTABQ3T906 1256 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CNNM4Q6P4Q7 775 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RAD54LQ92698 747 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GSDMAQ96QA5 445 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TUFT1Q9NNX1 390 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CREBZFQ9NS37 354 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ANO10Q9NW15 660 aa12.89□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 POTEB3A0JP26 581 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TLR2O60603 784 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SMC2O95347 1197 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MRE11P49959 708 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 NLRP12P59046 1061 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KRT76Q01546 638 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EPHA7Q15375 998 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF792Q3KQV3 632 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 POTEBQ6S5H4 581 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 C17orf99Q6UX52 265 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KCNK18Q7Z418 384 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GPR142Q7Z601 462 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CATSPER3Q86XQ3 398 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RDM1Q8NG50 284 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SMARCE1Q969G3 411 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SENP7Q9BQF6 1050 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 BPIFA3Q9BQP9 254 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 RBSNQ9H1K0 784 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.88□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ATP9AO75110 1047 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 PGK2P07205 417 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SFNP31947 248 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 AFMP43652 599 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 JAK3P52333 1124 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 NOGQ13253 232 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MORC3Q14149 939 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 TRIM9Q9C026 710 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.87□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 POTEFA5A3E0 1075 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ASB14A6NK59 587 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 KLRC4O43908 158 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 SLITRK3O94933 977 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 LYPLA2O95372 231 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 ALDH1A1P00352 501 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 BMP6P22004 513 aa12.86□□□□□ -0.35
C9orf3-220ENST00000489318 YY1P25490 414 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms