RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	EPHB6	O15197	1021 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC37A4	O43826	429 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	GFPT2	O94808	682 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	CYP3A7	P24462	503 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	RFC4	P35249	363 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	RASSF7	Q02833	373 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TMEM39B-208	ENST00000487305	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZBTB5	O15062	677 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TDP2	O95551	362 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYBL2	P10244	700 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EPS15	P42566	896 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAF4B	Q92750	862 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC1A4	P43007	532 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TNNI2	P48788	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CUL1	Q13616	776 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CLUL1	Q15846	466 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	VPS72	Q15906	364 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ASIC2	Q16515	512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CFAP58	Q5T655	872 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZMYND10	O75800	440 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NOL4	O94818	638 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	UFL1	O94874	794 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	POTEM	A6NI47	508 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HAS1	Q92839	578 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCDC188	H7C350	402 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PRKCI	P41743	596 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NPEPPS	P55786	919 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPSM2	P81274	684 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	NFIX	Q14938	502 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMEM39B-208	ENST00000487305	COA7	Q96BR5	231 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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