RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-209ENST00000486016 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 IER2Q9BTL4 223 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 JAM3Q9BX67 310 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 MYOTQ9UBF9 498 aa6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF20P17024 532 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 SGSM3Q96HU1 749 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 C8orf49Q96NF6 230 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 TMEM209Q96SK2 561 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 MENTQ9BUN1 341 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 ST7Q9NRC1 585 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.55□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 NTRK3Q16288 839 aa6.54□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.54□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.54□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 OSBP2Q969R2 916 aa6.54□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 CLIC6Q96NY7 704 aa6.54□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 AGRPO00253 132 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 LAMTOR5O43504 91 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 CDSNQ15517 529 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 DTX3Q8N9I9 347 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 DNERQ8NFT8 737 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 LOXL4Q96JB6 756 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 MRIQ9BWK5 157 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.53□□□□□ -1.36
GCFC2-209ENST00000486016 SLC27A2O14975 620 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 GPR42O15529 346 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 FGFR1P11362 822 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 EPHB4P54760 987 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 LBX2Q6XYB7 198 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 USP53Q70EK8 1073 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF428Q96B54 188 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 CD248Q9HCU0 757 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.52□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KRIT1O00522 736 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 MAFKO60675 156 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 CYP7B1O75881 506 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KLHL18O94889 574 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 C6P13671 934 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 SURF1Q15526 300 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 DCAF4Q8WV16 495 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 WRNIP1Q96S55 665 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 CROTQ9UKG9 612 aa6.51□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 GDF5P43026 501 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ICAM4Q14773 271 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ZNF536O15090 1300 aa6.5□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PRODHO43272 600 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 SLPIP03973 132 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 FAHP16930 419 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 EPHA5P54756 1037 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PPP2CBP62714 309 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PPP2CAP67775 309 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 GRIN1Q05586 938 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 NFATC3Q12968 1075 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 TUSC3Q13454 348 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 STYK1Q6J9G0 422 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 NUDT11Q96G61 164 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 PTPN18Q99952 460 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 DLL4Q9NR61 685 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 ASXL2Q76L83 1435 aa6.49□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 KNG1P01042 644 aa6.48□□□□□ -1.37
GCFC2-209ENST00000486016 LTFP02788 710 aa6.48□□□□□ -1.37
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