RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3C2GO75747 1445 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 IQGAP1P46940 1657 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SCRN1Q12765 414 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 LZTR1Q8N653 840 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 GULP1Q9UBP9 304 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 METP08581 1390 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ALKQ9UM73 1620 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 FAM129CQ86XR2 697 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 USP33Q8TEY7 942 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 C20orf173Q96LM9 149 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC1BQ9P126 229 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-211ENST00000484135 STRCQ7RTU9 1775 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 B2RBV5 119 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NPHS1O60500 1241 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 GLI4P10075 376 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 LIMS1P48059 325 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PRR5P85299 388 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 VMACQ2NL98 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ALG3Q92685 438 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PWWP2AQ96N64 755 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TBX22Q9Y458 520 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 USP47Q96K76 1375 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRUQ92729 1446 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS20P59510 1910 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 DDAH1O94760 285 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PLS3P13797 630 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SV2CQ496J9 727 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PRAM1Q96QH2 718 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 LGR4Q9BXB1 951 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 POGKQ9P215 609 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRB1O14514 1584 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 MED14O60244 1454 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf72A4D263 438 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM13O60858 407 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 THBDP07204 575 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA6P17658 529 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ETFBP38117 255 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 ARID5AQ03989 594 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 NETO2Q8NC67 525 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 COPS5Q92905 334 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PEX11GQ96HA9 241 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 TINF2Q9BSI4 451 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 BTG4Q9NY30 223 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SUSD5O60279 629 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FUCA1P04066 466 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FGRP09769 529 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 SYN1P17600 705 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 FXNQ16595 210 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-211ENST00000484135 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.49□□□□□ -1.37
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