RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481605.5

TTC3-217, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 1,540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-217ENST00000481605 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 VCANP13611 3396 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 TET1Q8NFU7 2136 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 KRT32Q14532 448 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 USP38Q8NB14 1042 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 GPR20Q99678 358 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 NBNO60934 754 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.97■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 ZBTB43O43298 467 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SP4Q02446 784 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 ADGRE1Q14246 886 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 RTN1Q16799 776 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 CXCL10P02778 98 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 CA3P07451 260 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 IGFBP4P22692 258 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 KCNJ6P48051 423 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 SERINC5Q86VE9 423 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 GPRASP2Q96D09 838 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.95■■□□□ 1.91
TTC3-217ENST00000481605 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TRIM50Q86XT4 487 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 PPM1EQ8WY54 764 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 ITGB5P18084 799 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 HOXC8P31273 242 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 CDHR1Q96JP9 859 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 KIF28PB7ZC32 967 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 ATP9AO75110 1047 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 THPOP40225 353 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 FUT2Q10981 343 aa26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 MYO9BQ13459 2157 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TREHO43280 583 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 KCNA2P16389 499 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 NAPAP54920 295 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 MBTPS1Q14703 1052 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TCTN1Q2MV58 587 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 FGD1P98174 961 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 MTMR1Q13613 665 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 SETD4Q9NVD3 440 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TLL1O43897 1013 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 RSPH10BP0C881 870 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 CPA1P15085 419 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 JADE2Q9NQC1 790 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 GNAT1P11488 350 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 CDC27P30260 824 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 DEFB103AP81534 67 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 IKBKEQ14164 716 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 KCNB2Q92953 911 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 CERS4Q9HA82 394 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 EMSYQ7Z589 1322 aa26.9■■□□□ 1.9
TTC3-217ENST00000481605 LGR5O75473 907 aa26.89■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 RCAN1P53805 252 aa26.89■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.89■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 STXBP3O00186 592 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 MAFGO15525 162 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 EFCAB14O75071 495 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 ARHGEF15O94989 841 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 HSPA4P34932 840 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 TAP1Q03518 808 aa26.88■■□□□ 1.89
TTC3-217ENST00000481605 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms