RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 GPR20Q99678 358 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 HAS3O00219 553 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 F2P00734 622 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ARP10275 920 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 RAG1P15918 1043 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PSEN2P49810 448 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 NPY5RQ15761 445 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM86B1E9PN63 330 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TIMP1P01033 207 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CHMP4BP1P59074 171 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 LTBP2Q14767 1821 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPC1 479 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 M0R2N6 131 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 EDIL3O43854 480 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF76P36508 570 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 MFSD10Q14728 455 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SESTD1Q86VW0 696 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 BLIDQ8IZY5 108 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 ALG1Q9BT22 464 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 LGALS2P05162 132 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SP4Q02446 784 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 RABEP1Q15276 862 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 GALNT17Q6IS24 598 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 JAK2O60674 1132 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CIITAP33076 1130 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 WASF1Q92558 559 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 NFASCO94856 1347 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 MFSD5Q6N075 450 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 C7orf31Q8N865 590 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 HIPK3Q9H422 1215 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 H3BRB1 525 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CYP2C9P11712 490 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 XBP1P17861 261 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CYP2C18P33260 490 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TDHQ8IZJ6 230 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TBCKQ8TEA7 893 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 USP11P51784 963 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 EPHB4P54760 987 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 FPGSQ05932 587 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 PTGISQ16647 500 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 TRIM50Q86XT4 487 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SDF4Q9BRK5 362 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 BACH2Q9BYV9 841 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-211ENST00000480301 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 HIC1Q14526 733 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 OXER1Q8TDS5 423 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 LENG9Q96B70 501 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 PRR16Q569H4 304 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-211ENST00000480301 TMEM199Q8N511 208 aa23.81■■□□□ 1.4
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