RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 PFKFB1P16118 471 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 MTMR1Q13613 665 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 USP49Q70CQ1 688 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 SLC5A5Q92911 643 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 APBA2Q99767 749 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 HPSEQ9Y251 543 aa29.2■■■□□ 2.27
SOBP-202ENST00000477448 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.2■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 GJB1P08034 283 aa29.2■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 NDUFA8P51970 172 aa29.2■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 EPSTI1Q96J88 318 aa29.2■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 AK8Q96MA6 479 aa29.2■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 NR1I2O75469 434 aa29.19■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 NLRX1Q86UT6 975 aa29.19■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 MORC4Q8TE76 937 aa29.19■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.19■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.19■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 GJA8P48165 433 aa29.17■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 SPIRE1Q08AE8 756 aa29.17■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 POTEMA6NI47 508 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 ASB14A6NK59 587 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 PP2D1A8MPX8 630 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 PSMD10O75832 226 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 GNPTABQ3T906 1256 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 LRCH2Q5VUJ6 765 aa29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 DACT1Q9NYF0 836 aa29.16■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.15■■■□□ 2.26
SOBP-202ENST00000477448 WDR81Q562E7 1941 aa29.14■■■□□ 2.26
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SOBP-202ENST00000477448 UBA7P41226 1012 aa29.13■■■□□ 2.25
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SOBP-202ENST00000477448 KINO60870 393 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
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