RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 SETD4Q9NVD3 440 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 COL4A6Q14031 1691 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 H3BRB1 525 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ATP9AO75110 1047 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 CTSHP09668 335 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ICAM3P32942 547 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IKBKEQ14164 716 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 AAK1Q2M2I8 961 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 USP17L6PQ6QN14 398 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IL27Q8NEV9 243 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 GPR20Q99678 358 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MYL10Q9BUA6 226 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SIP14410 1827 aa12.59□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PIEZO1Q92508 2521 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 C17orf102A2RUQ5 167 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 E7EWF7 191 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MEIS2O14770 477 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 POLR2MP0CAP2 368 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 KCNA5P22460 613 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CHMLP26374 656 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 NT5C2P49902 561 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 EPC2Q52LR7 807 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TTC22Q5TAA0 569 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CYFIP1Q7L576 1253 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 FAM178BQ8IXR5 827 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 NEK9Q8TD19 979 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 ATP6V0A1Q93050 837 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TOP1MTQ969P6 601 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CTNNA3Q9UI47 895 aa12.58□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PI4K2BG5E9Z4 385 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 H3BQ06 376 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CHRNA1P02708 482 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TGFB3P10600 412 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CCND2P30279 289 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LTBRP36941 435 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MGAT3Q09327 533 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 COL19A1Q14993 1142 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 FAM26DQ5JW98 314 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 METTL7BQ6UX53 244 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 C5orf42Q9H799 3197 aa12.57□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 POTEB3A0JP26 581 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GPR37L1O60883 481 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 UPP2O95045 317 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHA8P1O95397 391 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 POTEBQ6S5H4 581 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 EHMT1Q9H9B1 1298 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 LY9Q9HBG7 655 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 INSL6Q9Y581 213 aa12.56□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 H3BNC9 293 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 HIP1O00291 1037 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 AMHP03971 560 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 KCNA2P16389 499 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 ITGB5P18084 799 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 RXRAP19793 462 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 SP4Q02446 784 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 CAMK1Q14012 370 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 TMEM31Q5JXX7 168 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 KCNV1Q6PIU1 500 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.55□□□□□ -0.4
NISCH-206ENST00000474188 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms