RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463022.1

SP110-208, Transcript of SP110 nuclear body protein, human

TSL 2

Gene SP110, Length 405 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP110-208	ENST00000463022	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GDF15	Q99988	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	STXBP3	O00186	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MAFG	O15525	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FIBP	O43427	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CDKL5	O76039	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ARIH2	O95376	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CD4	P01730	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MMP3	P08254	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CLTB	P09497	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SCG2	P13521	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GNA11	P29992	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ADCY7	P51828	1080 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NAPA	P54920	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BEX3	Q00994	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TLE2	Q04725	743 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NEDD9	Q14511	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NTRK3	Q16288	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DGKD	Q16760	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	CPLX1	O14810	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PFKFB2	O60825	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SP110-208	ENST00000463022	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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