RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, human

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS3-208	ENST00000457718	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	GDF11	O95390	407 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RCAN1	P53805	252 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	COASY	Q13057	564 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	GRM4	Q14833	912 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718		A0A1W2PRG0	241 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ORC4	O43929	436 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	KLRC1	P26715	233 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	STXBP3	O00186	592 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	KCNH2	Q12809	1159 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ICE2	Q659A1	982 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	EPHB6	O15197	1021 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SORBS3	O60504	671 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SERPING1	P05155	500 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CLTA	P09496	248 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	COPB2	P35606	906 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	KCNB1	Q14721	858 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	BICD1	Q96G01	975 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MAP2K7	O14733	419 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	KRT5	P13647	590 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MAP2K2	P36507	400 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MESD	Q14696	234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SLC37A4	O43826	429 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	FGG	P02679	453 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MYL1	P05976	194 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	DAPK3	O43293	454 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	TMOD1	P28289	359 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TNS3-208	ENST00000457718	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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