RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPFIA4O75335 1185 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDH10Q9P2E7 1040 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LTBP2Q14767 1821 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOP56O00567 594 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLTBP09497 229 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAAP100Q0VG06 881 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KAT2BQ92831 832 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EDIL3O43854 480 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF286BP0CG31 522 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NBPF20Q3BBV1 942 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLA2G4DQ86XP0 818 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBCKQ8TEA7 893 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPR20Q99678 358 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CIITAP33076 1130 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCM2P49736 904 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SP4Q02446 784 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OXER1Q8TDS5 423 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMX3Q96JJ7 454 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TLR3O15455 904 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 F2P00734 622 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 USP11P51784 963 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FOSBP53539 338 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHMP4BP1P59074 171 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM43BA6NCK2 446 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD4P01730 458 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSEN2P49810 448 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM47CQ5HY64 1035 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C16orf70Q9BSU1 422 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KATNAL1Q9BW62 490 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM39AQ9NV64 488 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NFASCO94856 1347 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LGALS2P05162 132 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT2P35908 639 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM29Q14134 588 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT40Q6A162 431 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SDF4Q9BRK5 362 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HAS3O00219 553 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA0355O15063 1070 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 B4GALT4O60513 344 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MMP1P03956 469 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MFSD10Q14728 455 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRR16Q569H4 304 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRMS1Q9HCU9 246 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBX21Q9UL17 535 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INF2Q27J81 1249 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA0753Q2KHM9 967 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHRDL2Q6WN34 429 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LENG9Q96B70 501 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NR5A1Q13285 461 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEPT1Q8WYJ6 367 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UIMC1Q96RL1 719 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GDF15Q99988 308 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BRB1 525 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITGB8P26012 769 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SESTD1Q86VW0 696 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNFRSF25Q93038 417 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C8orf76Q96K31 380 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DHX15O43143 795 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TDP2O95551 362 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GUCY1B3Q02153 619 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM50Q86XT4 487 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms