RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427771.1

TRAK1-205, Transcript of trafficking kinesin protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAK1, Length 900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1-205ENST00000427771 GPR20Q99678 358 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 IL23AQ9NPF7 189 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 NOD1Q9Y239 953 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 IFNAR1P17181 557 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 STK3Q13188 491 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 MTMR1Q13613 665 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 HIC1Q14526 733 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 DEFB123Q8N688 67 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 SEC24BO95487 1268 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 JADE2Q9NQC1 790 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 ESYT2A0FGR8 921 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 SREBF1P36956 1147 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 AP3B2Q13367 1082 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 RASIP1Q5U651 963 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 CDHR1Q96JP9 859 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAK1-205ENST00000427771 H3BRB1 525 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 PITPNM1O00562 1244 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ANAPC15P60006 121 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 WNT8BQ93098 351 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ARHGAP4P98171 946 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 BFSP2Q13515 415 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TET1Q8NFU7 2136 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 HERVK_113Q902F9 699 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 FAM161BQ96MY7 647 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 C6orf50Q9HD87 102 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GBF1Q92538 1859 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 DTNBO60941 627 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 FGBP02675 491 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 IQCF3P0C7M6 154 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ARP10275 920 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CEP55Q53EZ4 464 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 RETREG2Q8NC44 543 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CPLX1O14810 134 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 AK2P54819 239 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SCRN1Q12765 414 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CAGE1Q8TC20 777 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 IL17RAQ96F46 866 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 AIFM3Q96NN9 605 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 FAM86B1E9PN63 330 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 HOXC8P31273 242 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 PTK7Q13308 1070 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 MEIS1O00470 390 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 MAFGO15525 162 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 CKBP12277 381 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 SELPP16109 830 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 GNA11P29992 359 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF76P36508 570 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 RBL2Q08999 1139 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAK1-205ENST00000427771 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms