RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNA2P16389 499 aa28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 PSEN2P49810 448 aa28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF3C6Q969F1 213 aa28.53■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ARP10275 920 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD10Q14728 455 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP55Q53EZ4 464 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 MCTP2Q6DN12 878 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR20Q99678 358 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.52■■■□□ 2.16
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HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2C9P11712 490 aa28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.51■■■□□ 2.15
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HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2C18P33260 490 aa28.5■■■□□ 2.15
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HTATSF1-202ENST00000425695 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 STK36Q9NRP7 1315 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 MEIS1O00470 390 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 F2P00734 622 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 LGALS2P05162 132 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 BLIDQ8IZY5 108 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 C7orf31Q8N865 590 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 HIPK3Q9H422 1215 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM86B1E9PN63 330 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 HAS3O00219 553 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP3A4P08684 503 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 TDHQ8IZJ6 230 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NOD1Q9Y239 953 aa28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PPC1 479 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHB4P54760 987 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FPGSQ05932 587 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PTGISQ16647 500 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD5Q6N075 450 aa28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 H3BRB1 525 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 JAK2O60674 1132 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL23P55773 120 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ST3GAL1Q11201 340 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NPY5RQ15761 445 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM50Q86XT4 487 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 SDF4Q9BRK5 362 aa28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1-202ENST00000425695 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 XBP1P17861 261 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SHHQ15465 462 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT17Q6IS24 598 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SESTD1Q86VW0 696 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 WASF1Q92558 559 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF20Q9BVI0 1012 aa28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.44■■■□□ 2.14
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HTATSF1-202ENST00000425695 FOSBP53539 338 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM199Q8N511 208 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 M0R2N6 131 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EDIL3O43854 480 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RABEP1Q15276 862 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR16Q569H4 304 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TBCKQ8TEA7 893 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NFASCO94856 1347 aa28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ACRP10323 421 aa28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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