RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SART3Q15020 963 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TERF2Q15554 542 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGL3Q3MIN7 710 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BROXQ5VW32 411 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SKAP1Q86WV1 359 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC103Q8IW40 242 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFHBQ8N7U6 833 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HPS3Q969F9 1004 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYD88Q99836 296 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRIN2BQ13224 1484 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WASHC2AQ641Q2 1341 aa4.72□□□□□ -1.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL33A6NCF5 533 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM177BA6PVY3 158 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AP1G1O43747 822 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL33O95760 270 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNJ6P48051 423 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IREB2P48200 963 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RENBPP51606 427 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF4P78317 190 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDCD1Q15116 288 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DACT2Q5SW24 774 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LBX2Q6XYB7 198 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASSF3Q86WH2 238 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FIBCD1Q8N539 461 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCT2Q8NC54 265 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL17REQ8NFR9 667 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELOA3Q8NG57 546 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JADE3Q92613 823 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ISL2Q96A47 359 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP26Q9BXU7 913 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXQ1Q9C009 403 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDIP1Q9H305 208 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MKS1Q9NXB0 559 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.71□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MEGF11A6BM72 1044 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DVL2O14641 736 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TUSC2O75896 110 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THBDP07204 575 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POU2F2P09086 479 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADH6P28332 368 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NLRP12P59046 1061 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMPD2Q01433 879 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA5AQ13591 1074 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MOGSQ13724 837 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTLL4Q14679 1199 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP2R5DQ14738 602 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ELF2Q15723 593 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDB1Q16531 1140 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LILRA6Q6PI73 481 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR18Q8N4B5 295 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUDT8Q8WV74 236 aa4.7□□□□□ -1.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POF1BQ8WVV4 589 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms