RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 C5orf60A6NFR6 353 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KRT2P35908 639 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KIF5AQ12840 1032 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 PTGISQ16647 500 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 SBK1Q52WX2 424 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.773e-9■■□□□ 13.8
EFTUD2-201ENST00000402521 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA1328Q86T90 577 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 EDEM3Q9BZQ6 932 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 SH2D4AQ9H788 454 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 KLC4Q9NSK0 619 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 ORC4O43929 436 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 FGRP09769 529 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 IDEP14735 1019 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 ELF1P32519 619 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 SATB1Q01826 763 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 LMNB2Q03252 620 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM114A1Q8IWE2 563 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 IFT20Q8IY31 132 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 CAGE1Q8TC20 777 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 VEZTQ9HBM0 779 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD2-201ENST00000402521 ATP8B3O60423 1300 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 GHRP10912 638 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RDXP35241 583 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 NT5C2P49902 561 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 PAK2Q13177 524 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 KCTD1Q719H9 257 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 GPATCH11Q8N954 259 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ZBTB9Q96C00 473 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CUEDC2Q9H467 287 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 DNAJC18Q9H819 358 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 MYH1P12882 1939 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC8A1P32418 973 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 STX17P56962 302 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC40Q4G0X9 1142 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 KLHL10Q6JEL2 608 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 DLK2Q6UY11 383 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 GIMAP7Q8NHV1 300 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 VPS16Q9H269 839 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 MAD2L2Q9UI95 211 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ENC1O14682 589 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RHOBTB3O94955 611 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RPN1P04843 607 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CASP1P29466 404 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC8A3P57103 927 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SPDYCQ5MJ68 293 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 STAMQ92783 540 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 MIEF2Q96C03 454 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 EPSTI1Q96J88 318 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 EXOC1Q9NV70 894 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 KLRF2D3W0D1 207 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CALM1P0DP23 149 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CALM2P0DP24 149 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 CALM3P0DP25 149 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 NLRP5P59047 1200 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 SLMAPQ14BN4 828 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-201ENST00000402521 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms