RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 BLIDQ8IZY5 108 aa6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 DCAF4Q8WV16 495 aa6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 JDP2Q8WYK2 163 aa6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 CABP5Q9NP86 173 aa6.88□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.88□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GVL5 298 aa6.87□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF202O95125 648 aa6.87□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TTC38Q5R3I4 469 aa6.87□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 FERMT2Q96AC1 680 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PIGSQ96S52 555 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 CSRNP1Q96S65 589 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.87□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.87□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ICA1Q05084 483 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 GRIN1Q05586 938 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 GINM1Q9NU53 330 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TMX2Q9Y320 296 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.86□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 MYH8P13535 1937 aa6.86□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PRG0 241 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 SHTN1A0MZ66 631 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 SMCO2A6NFE2 343 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 F5H6K3 240 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 M0R082 166 aa6.85□□□□□ -1.31
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C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB5O15062 677 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 EDIL3O43854 480 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G6O60733 806 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFB10O96000 172 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 GH2P01242 217 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 CAP2P40123 477 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PRPHP41219 470 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 NAPAP54920 295 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 KLRC3Q07444 240 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 SLFN13Q68D06 897 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.85□□□□□ -1.31
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.85□□□□□ -1.31
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