RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CTNND2Q9UQB3 1225 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB39O15060 712 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NR3C2P08235 984 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SETQ01105 290 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CNTN2Q02246 1040 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PPP2R5CQ13362 524 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ERMNQ8TAM6 284 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DYDC2Q96IM9 177 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 IFNKQ9P0W0 207 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.18■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 FANCCQ00597 558 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 FSTL1Q12841 308 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TPH2Q8IWU9 490 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DRC7Q8IY82 874 aa17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 BCRP11274 1271 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TPM4P67936 248 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SNAPC2Q13487 334 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MTMR1Q13613 665 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ARSHQ5FYA8 562 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD35Q8N283 1001 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 TEKT3Q9BXF9 490 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 POLD4Q9HCU8 107 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A2Q9NP94 309 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2C8P10632 490 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 IDEP14735 1019 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PTPN21Q16825 1174 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CST9Q5W186 159 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NIPA1Q7RTP0 329 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ADSSL1Q8N142 457 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MB21D1Q8N884 522 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CHST13Q8NET6 341 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NELFBQ8WX92 580 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 EXOC1Q9NV70 894 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 DNM3Q9UQ16 869 aa17.16■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ASTN1O14525 1302 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 RGS20O76081 388 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 PMS1P54277 932 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SLC12A3P55017 1021 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA1Q5VX52 437 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 UNC13DQ70J99 1090 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 GPBP1Q86WP2 473 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 MS4A4AQ96JQ5 239 aa17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CASQ1-201ENST00000368078 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM49BA6NDI0 452 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SLC26A4O43511 780 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF18P17022 549 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CYP11B2P19099 503 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 OSBPP22059 807 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCND2P30279 289 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA3FQ13275 785 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 BANK1Q8NDB2 785 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 RIT2Q99578 217 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 ERCC3P19447 782 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 PAK1Q13153 545 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 EPHA7Q15375 998 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.14■□□□□ 0.33
CASQ1-201ENST00000368078 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms