RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WASF3Q9UPY6 502 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 B4GALT4O60513 344 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF623O75123 536 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SCG5P05408 212 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL6A1P12109 1028 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HOXC12P31275 282 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GFRA1P56159 465 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LSAMPQ13449 338 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TESK1Q15569 626 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SV2CQ496J9 727 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PHF19Q5T6S3 580 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM145Q8NBT3 493 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NUDT11Q96G61 164 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SUSD5O60279 629 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TADA3O75528 432 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CPP00450 1065 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VAMP1P23763 118 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VASNQ6EMK4 673 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM178BQ8IXR5 827 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C1orf159Q96HA4 380 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GNRHR2Q96P88 292 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAFKO60675 156 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KLHL18O94889 574 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRIN1Q05586 938 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HS1BP3Q53T59 392 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PROSER1Q86XN7 944 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DTX3Q8N9I9 347 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 Q8TCH9 128 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC140Q96MF4 163 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LMF1Q96S06 567 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DLL4Q9NR61 685 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRIT1O00522 736 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC27A2O14975 620 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FOXS1O43638 330 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FBXO21O94952 628 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KNG1P01042 644 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GLRBP48167 497 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 Q6ZUG5 572 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 JAM3Q9BX67 310 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDIP1Q9H305 208 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEC61A2Q9H9S3 476 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZFP69BQ9UJL9 534 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DDAH1O94760 285 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF202O95125 648 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CHGBP05060 677 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CSF2RBP32927 897 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GRIA2P42262 883 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TUSC3Q13454 348 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FHL2Q14192 279 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TNNI3KQ59H18 835 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 STPG3Q8N7X2 389 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms