RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 MOCS3O95396 460 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MIS12Q9H081 205 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SAT1P21673 171 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ABCA6Q8N139 1617 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CPDO75976 1380 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PPFIA4O75335 1185 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MYO1FO00160 1098 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 BPIFB4P59827 614 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PARVGQ9HBI0 331 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PSAPP07602 524 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GBP1P32455 592 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SNX1Q13596 522 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FAM160B2Q86V87 743 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MAPK4P31152 587 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 LLGL1Q15334 1064 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 THAP9Q9H5L6 903 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ECE2O60344 883 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R5EQ16537 467 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SGK1O00141 431 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 VGLL3A8MV65 326 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 CXCR5P32302 372 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NBPF3Q9H094 633 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 AFF2P51816 1311 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-201ENST00000361125 ZMYND10O75800 440 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 C2orf54Q08AI8 447 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PASKQ96RG2 1323 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 MYL1P05976 194 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CUL4BQ13620 913 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 FTCDO95954 541 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SCYL1Q96KG9 808 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 DGKHQ86XP1 1220 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CCNE1P24864 410 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SNX25Q9H3E2 840 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CD209Q9NNX6 404 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 RNF40O75150 1001 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 RESP18Q5W5W9 173 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CDHR1Q96JP9 859 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CD58P19256 250 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PCK1P35558 622 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 KIF11P52732 1056 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 OXER1Q8TDS5 423 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 DCAF4Q8WV16 495 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 A0A1B0GUA9 196 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 KCNQ2O43526 872 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 GPSM2P81274 684 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.86■■□□□ 1.25
SMURF1-201ENST00000361125 CSPG5O95196 566 aa22.86■■□□□ 1.25
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