RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 CEP135Q66GS9 1140 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 POTEGQ6S5H5 508 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 NSMFQ6X4W1 530 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 HPS3Q969F9 1004 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 INTS13Q9NVM9 706 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 WDR90Q96KV7 1748 aa22.62■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 PLA2G4BP0C869 781 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMC6Q7Z403 805 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 STK24Q9Y6E0 443 aa22.62■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 GRIN3BO60391 1043 aa22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 PSMC6P62333 389 aa22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 TREML2Q5T2D2 321 aa22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.61■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZMYND15Q9H091 742 aa22.61■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.61■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 IRF6O14896 467 aa22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATP2A1O14983 1001 aa22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 IDEP14735 1019 aa22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 BCRP11274 1271 aa22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC12A3P55017 1021 aa22.59■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ERO1BQ86YB8 467 aa22.59■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY3-201ENST00000329553 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.59■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 PXMP2Q9NR77 195 aa22.58■■□□□ 1.21
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RIPPLY3-201ENST00000329553 CYP11B2P19099 503 aa22.58■■□□□ 1.2
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RIPPLY3-201ENST00000329553 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3-201ENST00000329553 JADE2Q9NQC1 790 aa22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3-201ENST00000329553 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3-201ENST00000329553 A0A1B0GTH6 734 aa22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY3-201ENST00000329553 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
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