RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 CEP112Q8N8E3 955 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CETN2P41208 172 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PARVGQ9HBI0 331 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.37□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MYL1P05976 194 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 GBP3Q9H0R5 595 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 THAP9Q9H5L6 903 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PNMA2Q9UL42 364 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 COL18A1P39060 1754 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 TEX33O43247 280 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ABCB4P21439 1286 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CAP2P40123 477 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 VWA3BQ502W6 1294 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 DPYDQ12882 1025 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ELF2Q15723 593 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 GBP6Q6ZN66 633 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PEX3P56589 373 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MAP9Q49MG5 647 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FBXL16Q8N461 479 aa11.36□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 USP11P51784 963 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PSAPP07602 524 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 GAP43P17677 238 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CDR1P51861 262 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 LXNQ9BS40 222 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MYL7Q01449 175 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 WNT10BO00744 389 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ZBTB33Q86T24 672 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 IGSF3O75054 1194 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ERICH4A6NGS2 130 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CYTH3O43739 400 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MAN2A1Q16706 1144 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 TAX1BP1Q86VP1 789 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 MB21D1Q8N884 522 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC51Q96ER9 411 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 GAKO14976 1311 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 IQCB1Q15051 598 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SARM1Q6SZW1 724 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 KIFAP3Q92845 792 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 FAM20AQ96MK3 541 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 NOX5Q96PH1 765 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 BCRP11274 1271 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 LMNB1P20700 586 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 INPP5BP32019 993 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF384Q8TF68 577 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 IFT81Q8WYA0 676 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ATG4CQ96DT6 458 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PSMD2Q13200 908 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 PADI6Q6TGC4 694 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 ACCSQ96QU6 501 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 EHD4Q9H223 541 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 NOD1Q9Y239 953 aa11.34□□□□□ -0.59
TTPAL-201ENST00000262605 SHTN1A0MZ66 631 aa11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms