RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229330.8

HCFC2-201, Transcript of host cell factor C2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCFC2, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC2-201ENST00000229330 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PODXLO00592 558 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ACSL3O95573 720 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 NXNQ6DKJ4 435 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 STXBP3O00186 592 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GYG2O15488 501 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 DIAPH2O60879 1101 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CIAO1O76071 339 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CA4P22748 312 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ADORA1P30542 326 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 LSP1P33241 339 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 LIFRP42702 1097 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SNX24Q9Y343 169 aa14.95□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 POLD1P28340 1107 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SNX16P57768 344 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PHEXP78562 749 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CYTH2Q99418 400 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CASP1P29466 404 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SHC4Q6S5L8 630 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PMS2P54278 862 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SPARCL1Q14515 664 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 TPH2Q8IWU9 490 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SPAG7O75391 227 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 STK17AQ9UEE5 414 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.94□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 MX2P20592 715 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 TC2NQ8N9U0 490 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CD248Q9HCU0 757 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 A0A1B0GTH6 734 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 KLRF2D3W0D1 207 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 LRRC63Q05C16 580 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 KAZNQ674X7 775 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GJA10Q969M2 543 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GFPT2O94808 682 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 RWDD2BP57060 319 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 DISC1Q9NRI5 854 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SNX12Q9UMY4 172 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SCINQ9Y6U3 715 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 MYL7Q01449 175 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 STK32BQ9NY57 414 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 MED14O60244 1454 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SLC20A2Q08357 652 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CRYMQ14894 314 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.93□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 WDR91A4D1P6 747 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 LRRC53A6NM62 1247 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 STMN1P16949 149 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CXorf38Q8TB03 319 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 BACH1O14867 736 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 MT-ND3P03897 115 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 PLCG1P19174 1290 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ADD2P35612 726 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 OLFM3Q96PB7 478 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.92□□□□□ -0.02
HCFC2-201ENST00000229330 ZNF185O15231 689 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms