RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 PNOCQ13519 176 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 SLMAPQ14BN4 828 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 C12orf60Q5U649 245 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 CAPN2P17655 700 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 MYO1EQ12965 1108 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 CEP72Q9P209 647 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 26.2
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SETX-201ENST00000224140 ALS2CLQ60I27 953 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 ARMCX2Q7L311 632 aa6.9□□□□□ -1.3
SETX-201ENST00000224140 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
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SETX-201ENST00000224140 CAMTA2O94983 1202 aa6.9□□□□□ -1.3
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SETX-201ENST00000224140 STXBP2Q15833 593 aa6.9□□□□□ -1.3
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SETX-201ENST00000224140 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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SETX-201ENST00000224140 TGFB2P61812 414 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 HLFQ16534 295 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.9□□□□□ -1.31
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SETX-201ENST00000224140 MYO1FO00160 1098 aa6.9□□□□□ -1.31
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SETX-201ENST00000224140 MYBPC2Q14324 1141 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CHD4Q14839 1912 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZNF677Q86XU0 584 aa6.9□□□□□ -1.31
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SETX-201ENST00000224140 TPH2Q8IWU9 490 aa6.9□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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SETX-201ENST00000224140 PAX3P23760 479 aa6.89□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CIITAP33076 1130 aa6.89□□□□□ -1.31
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