RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 FECHP22830 423 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 GCKRQ14397 625 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 RPS6KA1Q15418 735 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CD302Q8IX05 232 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MTFR1LQ9H019 292 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 A6NHS1 94 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 IGKV5-2P06315 115 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 COPS2P61201 443 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 RIPK1Q13546 671 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MTMR3Q13615 1198 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 SEPT2Q15019 361 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 INTUQ9ULD6 942 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ABCC6O95255 1503 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 TEX9Q8N6V9 391 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LPIN2Q92539 896 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 USP6P35125 1406 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 HOOK3Q86VS8 718 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 PREBQ9HCU5 417 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ETS2P15036 469 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 UBE4AQ14139 1066 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 UCMAQ8WVF2 138 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CNKSR1Q969H4 720 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MTMR7Q9Y216 660 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC10BA6NIK2 292 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MYL1P05976 194 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 GSTA1P08263 222 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 TBC1D10CQ8IV04 446 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 BICD1Q96G01 975 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC53A6NM62 1247 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DYDC2Q96IM9 177 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 RAB17Q9H0T7 212 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 XDHP47989 1333 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 PLTPP55058 493 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DENND2CQ68D51 928 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CCDC160A6NGH7 325 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 KCNA3P22001 575 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 LRRC24Q50LG9 513 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF365Q70YC5 407 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 CCNJLQ8IV13 435 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 RUBCNQ92622 972 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 KIFAP3Q92845 792 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 COPRSQ9NQ92 184 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 FLOT1O75955 427 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 RARAP10276 462 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 ZAP70P43403 619 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRA-201ENST00000216877 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms