RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000112320.7

Spc25-202, Transcript of Kinetochore protein Spc25, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Spc25, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ccer1Q9CQL2 403 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Scrn1Q9CZC8 414 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gm7086A0A1W2P766 342 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pcdhb14Q6PB90 796 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Olfr832Q7TRG9 312 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Azin2Q8BVM4 459 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tas1r1Q99PG6 842 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Snrnp35Q9D384 244 aa20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ccdc112A0AUP1 442 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Guca2bO09051 106 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Btg4O70552 250 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gpatch11Q3UFS4 262 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ces1eQ64176 562 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Krt9Q6RHW0 743 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mtmr10Q7TPM9 771 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 IqcgQ80W32 419 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Map1sQ8C052 973 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nemp2Q8CB65 421 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Celf3Q8CIN6 465 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ifih1Q8R5F7 1025 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tas1r3Q925D8 858 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Iqca1Q9CUL5 857 aa20.62■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Col4a3Q9QZS0 1669 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 SrcapA0A087WQ44 3271 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gm20503G3UZK1 150 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 MafgO54790 162 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Prl2c1Q5SVL9 228 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Fscn1Q61553 493 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Trak2Q6P9N8 913 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 LpxnQ99N69 386 aa20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Wdr70Q3TWF6 657 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ccna1Q61456 421 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Epha7Q61772 998 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Calhm6Q8C9E8 313 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Arl6ip4Q9JM93 229 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Igbp1bQ9QZ29 343 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa20.6■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gm11549A0A286YD83 63 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Klhl33G3UW92 533 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Slc2a13Q3UHK1 637 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Hdac4Q6NZM9 1076 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Usp49Q6P9L4 685 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mtss1lQ6P9S0 715 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Vps16Q920Q4 839 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ranbp17Q99NF8 1088 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 DcpsQ9DAR7 338 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 IydQ9DCX8 285 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Lmbr1Q9JIT0 490 aa20.59■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 ZbbxQ0P5X5 716 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Kiaa1468Q148V7 1216 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Znf653Q6YND2 615 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nacc1Q7TSZ8 514 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Slc17a8Q8BFU8 601 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gjc2Q8BQU6 440 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 MafaQ8CF90 359 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Smc1bQ920F6 1248 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Dnajb2Q9QYI5 324 aa20.58■□□□□ 0.89
Spc25-202ENSMUST00000112320 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 StrnO55106 780 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Lta4hP24527 611 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nsun6Q7TS68 476 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tmem192Q9CXT7 266 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Smco2Q9DA21 347 aa20.58■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 UgcgO88693 394 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 MafbP54841 323 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 GaaP70699 953 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 HmgcrQ01237 887 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pnma5Q5DTT8 618 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Islr2Q5RKR3 745 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Phlda1Q62392 405 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ift122Q6NWV3 1182 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Iqsec1Q8R0S2 961 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mtmr14Q8VEL2 648 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pcdhb12Q91Y07 789 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Stxbp4Q9WV89 557 aa20.57■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nr1i2O54915 431 aa20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Il2rbP16297 539 aa20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gja8P28236 440 aa20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 PuraP42669 321 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Btbd1P58544 488 aa20.56■□□□□ 0.88
Spc25-202ENSMUST00000112320 Fads2p1Q0VAX3 487 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.3 ms