RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619059.4

FAM13C-218, Transcript of family with sequence similarity 13 member C, human

TSL 4

Gene FAM13C, Length 596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13C-218	ENST00000619059	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ACTN1	P12814	892 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ICAM3	P32942	547 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PSEN2	P49810	448 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SP2	Q02086	613 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	NEDD9	Q14511	834 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RAB30	Q15771	203 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	MEIS2	O14770	477 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	FIBP	O43427	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	FGD1	P98174	961 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	MFSD10	Q14728	455 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	HAS3	O00219	553 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ZBTB43	O43298	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SORBS3	O60504	671 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	F2	P00734	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	NEFL	P07196	543 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059		H3BRB1	525 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	REC8	O95072	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	FOSL2	P15408	326 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SELP	P16109	830 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PBX2	P40425	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	PTK7	Q13308	1070 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	RTN1	Q16799	776 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM13C-218	ENST00000619059	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	MAFG	O15525	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	RCAN1	P53805	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAM13C-218	ENST00000619059	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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