RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 PPP6R2O75170 966 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 STAM2O75886 525 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 BMP15O95972 392 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ICAM3P32942 547 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SLC5A5Q92911 643 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 GPRASP2Q96D09 838 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ERO1AQ96HE7 468 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CLIC6Q96NY7 704 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 GBP4Q96PP9 640 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PCNTO95613 3336 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CEP350Q5VT06 3117 aa23.7■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PRPHP41219 470 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SP2Q02086 613 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 LAD1O00515 517 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TBX3O15119 743 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ARIH2O95376 493 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 MCM4P33991 863 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR1Q13613 665 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TRIB2Q92519 343 aa23.68■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 B4DLN1 442 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 FOXN1O15353 648 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PSMD10O75832 226 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 KCNA2P16389 499 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CYP2C19P33261 490 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 IRF5Q13568 498 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 NLRX1Q86UT6 975 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 FAM20AQ96MK3 541 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 VAV3Q9UKW4 847 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.67■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PTGS1P23219 599 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TXKP42681 527 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 SHC4Q6S5L8 630 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 USP49Q70CQ1 688 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CSRNP2Q9H175 543 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 VTA1Q9NP79 307 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.66■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 CUTAO60888 179 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ME1P48163 572 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM32Q13049 653 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TRPV1Q8NER1 839 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 FERMT2Q96AC1 680 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CSAG3-202ENST00000617158 GNRH1P01148 92 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 TECP42680 631 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 ACVR2BQ13705 512 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 SPECC1Q5M775 1068 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 POTEFA5A3E0 1075 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 PP2D1A8MPX8 630 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 EML1O00423 815 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 MAFGO15525 162 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 ADCY6O43306 1168 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 ELNP15502 786 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 HOXD10P28358 340 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 GNPTABQ3T906 1256 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 ADALQ6DHV7 355 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 RIT2Q99578 217 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.63■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CSAG3-202ENST00000617158 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms