RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CACNB3P54284 484 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PARVGQ9HBI0 331 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 STX2P32856 288 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 OSTNP61366 133 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 C7orf31Q8N865 590 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO40Q9UH90 709 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 IFNAR1P17181 557 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 SURF1Q15526 300 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 MGARPQ8TDB4 240 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PODNQ7Z5L7 613 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 RNF181Q9P0P0 153 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PPARDQ03181 441 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 MESDQ14696 234 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDP1-208ENST00000613122 ELF1P32519 619 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SYNE4Q8N205 404 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 GCNAQ96QF7 691 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 WRNIP1Q96S55 665 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SASH1O94885 1247 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 GSTA1P08263 222 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 GSTA2P09210 222 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF853P0CG23 659 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TSC1Q92574 1164 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 CDKL2Q92772 493 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 MYL1P05976 194 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SAT1P21673 171 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 DPH5Q9H2P9 285 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 COBLO75128 1261 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.94■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 SATB1Q01826 763 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G4BP0C869 781 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT2Q15019 361 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF653Q96CK0 615 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP4Q96MN2 994 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 NR5A1Q13285 461 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 GNAT1P11488 350 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TCP11Q8WWU5 503 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 NUF2Q9BZD4 464 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 KRT10P13645 584 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 MAPK4P31152 587 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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CTDP1-208ENST00000613122 DGKHQ86XP1 1220 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 VCX3BQ9H321 246 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 PASKQ96RG2 1323 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L5A8MUK1 530 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 RNF40O75150 1001 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 MCAMP43121 646 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 FEM1BQ9UK73 627 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 LIFRP42702 1097 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 RASSF7Q02833 373 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 ALCAMQ13740 583 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-208ENST00000613122 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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